محورهای اصلی همایش بین المللی مخطوطات مشرق زمین از قرار ذیل است:
1. معرفی تفصیلی نسخه های ارزندۀ خطی در کتابخانه های قاره آسیا (در موضوعات مختلف)
2. فهرست نگاری مخطوطات در کتابخانه های شخصی، موزه ها و کتابخانه های جهان مربوط به مشرق زمین
3. مقایسه بین مخطوطات اسلامی و سایر ادیان
4. شیوه های نوین حفاظت و مرمت مخطوطات شرقی
5. شیوه های نوین فهرست نگاری مخطوطات شرقی
6. نقد کتابهای مصحّح و فهارس چاپ شده در حوزۀ مطالعات شرقی
7. شناسائی ظرفیتهای کتابخانه ها، مراکز تحقیقاتی، و موزه های واجد مخطوطات شرقی
8. تصحیح و احیای متون منتشر نشده (رسائل کوتاه، کتابهای خطی)
9. دیجیتال سازی مخطوطات شرقی/ راهکارهای نوین، چالشها و ظرفیتها
10. سایر موضوعات مرتبط به میراث کهن مخطوط
همچنین، دبیرخانه از گروههای علمی که قصد برگزاری پنل تخصصی شامل چند سخنرانی و مقاله، در موضوعات مرتبط را دارند استقبال می کند.